基于生物信息技术分析人参皂苷防治乳腺癌的作用机制

目的 运用生物信息学技术探讨人参皂苷调控乳腺癌潜在的作用机制。方法 从基因表达数据库(GEO)获取与乳腺癌相关的基因芯片GSE85871,并用GEO2R在线分析软件分析该芯片数据集,得Fludarabine体外到差异表达基因(DEGs)。分别运用Sanger Box和Graph Pad Prism 8图像处理软件对差异表达基因进行可视化处理。在SRING平台上构建蛋白互作(PPI)网络,利用Cytoscape 3.7软件分析该网络,获得核心基因。运用DAVID 6.8数据库对核心基因进行基因本体(GO)功能注释和京都基因百科全书(KEGG)通路富集。结果 从芯片数据集中https://www.selleck.cn/products/sc75741.html筛选出182个差异基因,其中上调基因有110个,下调基因有72个。核心基因涉及VEGFA,BMP4,SPARC,PLG,ITGB2,TEK,SERP,INA1,SERPINB5和IGFBP7。GO生物过程包括细胞黏附、蛋白质磷酸化的正调控、细胞间信号转导、胶质细胞迁移和血管生成的负调控等; KEGG信号通路包括细胞因子-细胞因子受体相互作用、阿米巴病、弓形体病和癌症中的微小RNA通路等。结论 人参皂苷通过多靶点、多条时间信号通路的共同作用,发挥抗乳腺癌的药理作用。

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