肿瘤患者血液中的肿瘤源性外泌体(tumor-derivedexosome,TEX)携带有与原肿瘤细胞一致的生物信息学特性,通过检测TEX可以无创、连续、实时监测肿瘤的发生发展情况,是卵巢癌早期诊断、治疗评估、预后随访潜在的有益指标。本文就TEX来源性质、在肿瘤微环境中的作用机制、目前分离鉴定技术及其在卵巢癌诊断治疗中应用的研究进展作一综述也。
目的探讨胶质母细胞瘤(GBM)驱动基因相关的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络。方法从癌症基因组图谱(TCGA)中下载169例GBM及5例正常组织长链非编码RNA(lncRNA)表达数据,从UCSC Xena数据库下载509例GBM及10例正常脑组织微小RNA(miRNA)表达数据。对获取的lnGSK458半抑制浓度cRNA及miRNA表达数据进行差异表达分析。GBM的17个驱动基因是从文献(PMID 30096302)中获得。miRcode,TargetScan,miRTarBase和miRDB数据库预测lncRNA、miRNA和GBM驱动基因之间的相互作用。结果 GBM组织TP53及PTEN突变率最高,达30%,且TP5GDC-0199说明书3错义突变最常见。筛选出差异表达lncRNA共2 445个,表达上调1 052个,下调1 393个;差异表达miRNA共56个,表达上调28个,下调28个。共有5个GBM驱动基因、6个miRNA及297个lncRNA筛选出用于构建ceRNA网络,包括HOX转录反义RNA在内的8个lncRNA与GBM病人的生存相关。结论采用生信分析方法构建ceRNA网络有助于深化GBM发生、发展机制的认识。